Principales cambios del 2003 al 2007:
En 2003, se hicieron mejoras en el chasis y la suspensión delantera. Se agregó una nueva horquilla invertida WP de 48 mm y se ajustaron las especificaciones del chasis para mejorar la estabilidad y el manejo. En el mismo año, también se hicieron mejoras en los frenos.
En 2004, se agregó una suspensión trasera PDS mejorada con un nuevo amortiguador.
En 2005, se realizó una actualización importante en el motor de las KTM 250/300 EXC. La moto recibió cambios en el chasis, un nuevo cilindro, culata, pistón y un nuevo sistema de escape. También se agregó un nuevo carburador Mikuni de 38 mm. Estos cambios mejoraron significativamente la potencia y el rendimiento del motor.
En 2006, se mejoró la ergonomía de la motocicleta, con una nueva forma del tanque de combustible, un asiento rediseñado y una posición de conducción mejorada. Estos cambios proporcionaron una mayor comodidad para el conductor y mejoraron el control de la motocicleta.
En 2007, se realizó una actualización menor en el motor, con una nueva culata y un sistema de admisión revisado. También se agregaron nuevas llantas Excel.